El Museo de Zoología ha obtenido ejemplares de referencia como producto de diferentes proyectos de investigación realizados en el la zona. Para la elaboración de los proyectos en los cuales se recolectaron ejemplares científicos, se tramitaron ante el Instituto Nacional de Ecología los permisos de recolecta correspondientes. A continuación se da una lista de los diferentes proyectos que nos han permitido mejorar y mantener las colecciones y han generado ejemplares de referencia: 1. “Proyecto de Ordenamiento Ecológico de la Zona Sur de Quintana Roo. Ambiente Terrestre: FAUNA". Financiamiento: Centro de Investigaciones de Quintana Roo. 1991. 2. "Elaboración del Banco de datos de las colecciones del Museo de Zoología-CIQRO" Proyecto financiado por CONABIO. 1993-1994. 3. "Caracterización ecológica de mamíferos del corredor turístico Cancun-Tulum. Finaciamiento: EPOMEX/ECOMAR. Octubre-Noviembre 1994. 4. “Capturas de aves terrestres para la formación del aviario Xaman-Ha de Playacar”. Proyecto financiado por SIDEK/PLAYACAR.1994-1995. 5. “Complemento de apoyo a la infraestructura del Museo de Zoología-CIQRO". Proyecto financiado por CONABIO. 1995. 6. "Formación de las colecciones de referencia de aves y mamíferos de la Reserva de la Biósfera de Sian Ka'an" Proyecto financiado por CONABIO. 1995-1996. 7. “Caracterización Ecológica de los Mamíferos de los Petenes de Campeche” Financiado por EPOMEX/ECOMAR. 1996. 8. “Complemento a la Infraestructura del Museo de Zoología ECOSUR” Financiado por CONABIO. 1996. 9. “Aprovechamiento de los recursos naturales para un desarrollo turístico sostenible en la zona Oxtankah-Chactemal. Fauna Silvestre: Mamíferos”. 1996. Financiamiento: Universidad de Quintana Roo-Gobierno del Estado de Quintana Roo. 10. “Estudio Integral para el control biológico de la mariposa nocturna Hylesia alinda causante de la dermatitis en los pobladores y visitantes de la Isla de Cozumel”. Sección: Mamíferos. Proyecto financiado por el Gobierno del estado de Quintana Roo en colaboracción con la Asociación de Hoteleros de la Isla de Cozumel. 1996-1997. 11. “Inventario y monitoreo de anfibios y mariposas de la Reserva de Calakmul, Campeche”. Proyecto en colaboración con la Universidad de Stanford, California. Financiado por CONABIO. 1997. 12. “Herpetofauna de la Reserva de la Biosfera Calakmul, Campeche”. Financiado por Pronatura Península de Yucatán. 1997-1998. 13. “Elaboración del Programa de Manejo de la Zona Sujeta a Conservación Ecológica, Santuario del Manatí, Bahía de Chetumal. Sección: Fauna”. 1998. Financiamiento: SIMAP/Gob. De Q. Roo. Chetumal, Q. Roo. . 14. “Estudio Técnico de la Segunda Ampliación Forestal del Ejido Dzibalchén, Campeche”, para su Declaratoria como Área Natural Protegida. Sección: Fauna. 1998. Financiamiento: Universidad Autónoma de Campeche, Centro EPOMEX; Secretaría de Ecología, Gobierno del Estado de Campeche; ECOSUR, Chetumal. 15. “Distribución del mono araña Ateles geoffroyi en Quintana Roo y su estado poblacional en el ejido de Petcacab”. 1999.Proyecto financiado por XCARET. 16. “Caracterización ecológica de la poblacion de murcielagos”. Financiado por Caribean Internacional S. A. de C. V. 1999. 17. “Inventario y monitoreo de anfibios, reptiles y mariposas de la Reserva de Calakmul, Campeche, Fase II”. Proyecto en colaboración con la Universidad de Stanford, California. Financiado por CONABIO. 1998-2000. 18. “Complemento para el inventario y monitoreo de anfibios, reptiles y mariposas en la Reserva de la Biósfera de Calakmul”. Proyecto financiado por AICA, TNC y PRONATURA Península de Yucatán. 1999-Junio de 2000. 19. “A training workshop: Use of new acoustic technology for the evaluation of La Selva Maya bat fauna”. 2001. Proyecto en Colaboración con la Wildlife Conservation Society. Financiado por USAID/México. 20. “Propuesta para la realización de 37 fichas biológicas de las especies de herpetofauna incluidas en la NOM-059 presentes en la Península de Yucatán”. Financiado por CONABIO 2001 21. “Monitoreo de especies prioritarias (anfibios, reptiles, aves y mamíferos) en el municipio de Calakmul, Campeche. Financiado por Pronatura Yucatán. 2001.